Le quechua s'écrit maintenant en caractères latins alors que le système phonologique du quechua est très différent de nos langues. Le système de transcription nécessite donc un gros travail. Dès 1580, un système graphique a été créé pour des personnes locutrices de la langue, système qui restera en vigueur jusqu'au milieu du XVIIIe siècle. Ensuite d'autres systèmes ont été élaborés mais ils n'ont pas été très consistants. Ce n'est qu'au milieu du XXe siècle qu'une unification et simplification des systèmes a été réellement mise en place. Ce système est de type phonologique et est actuellement utilisé au Pérou et en Bolivie.